Les effets secondaires concernent surtout les radiothérapies pratiquées au niveau du médiastin, de l'abdomen ou du pelvis. Ils varient selon le site irradié, la dose administrée et le débit de dose.
Les plus courants sont les suivantes :
- abdomen, pelvis : Anorexie, nausée, vomissements, douleurs abdominales, diarrhées, voire entérite, ultérieurement fistules, sténoses, occlusion ...
- voies aéro-digestives supérieures : altération du goût et de l'odorat, dysphagie, mucite, stomatite, oesophagite ….
- cérébrale : nausées, vomissements, anorexie liée aux céphalées ….